水體污染的危害是多方面的，這里簡單介紹一下水體污染對人體健康的影響 
（1）、引起急性和慢性中毒。水體受有毒有害化學(xué)物質(zhì)污染后，通過飲水或食物鏈便可能造成中毒。著名的水俁病、痛痛病是由水體污染引起的。 
（2）、致癌作用。某些有致癌作用的化學(xué)物質(zhì)如砷、鉻、鎳、鈹、苯胺、苯并(a)芘和其他多環(huán)芳烴、鹵代烴污染水體后，可被懸浮物、底泥吸附，也可在水生生物體內(nèi)積累，長期飲用含有這類物質(zhì)的水，或食用體內(nèi)蓄積有這類物質(zhì)的生物(如魚類)就可能誘發(fā)癌癥。
（3）、發(fā)生以水為媒介的傳染病。人畜糞便等生物污染物污染水體，可能引起細(xì)菌性腸道傳染病如傷寒、痢疾、腸炎、霍亂等；腸道內(nèi)常見病毒如脊髓灰質(zhì)類病毒、柯薩奇病毒、傳染性肝炎病毒等，皆可通過水體污染引起相應(yīng)的傳染病。1989年上海的"甲肝事件"，就是由水體污染引起的。在發(fā)展中國家，每年約有6000萬人死于腹瀉，其中大部分是兒童。
（4）、間接影響。水體污染后，常可引起水的感官性狀惡化，如某些污染物在一定濃度下，對人的健康雖無直接危害，但可使水發(fā)生異臭、異色，呈現(xiàn)泡沫和油膜等，妨礙水體的正常利用。銅、鋅、鎳等物質(zhì)在一定濃度下能抑制微生物的生長和繁殖，從而影響水中有機(jī)物的分解和生物氧化，使水體自凈能力下降，影響水體的衛(wèi)生狀況。
（5）、水體污染既可嚴(yán)重危害生態(tài)系統(tǒng)，還可造成嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。